Museum Gubug Wayang tidak hanya menyimpan berbagai koleksi yang berkaitan dengan wayang dan budaya Indonesia, tetapi juga memiliki beragam koleksi batuan dan kristal yang menarik untuk dipelajari.
Koleksi batuan dan kristal yang memperlihatkan keindahan serta keunikan proses alam yang berlangsung dalam waktu yang sangat panjang.